Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD4P09016 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD4P09016 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms