Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms