Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC099518.2-201ENST00000565802 704 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 808 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 SLC8A1-AS1-204ENST00000427354 790 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC013402.3-201ENST00000438566 451 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP3Q9H4L4 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms