Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL4Q9C0H6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms