Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC35A4Q96G79 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms