Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms