Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms