Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTF1AQ7RTS3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTF1AQ7RTS3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms