Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6P435 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6P435 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6P435 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6P435 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6P435 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6P435 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6P435 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6P435 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q6P435 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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