Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms