Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms