Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.05■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf46Q504U0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf46Q504U0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms