Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HERPUD1Q15011 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HERPUD1Q15011 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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