Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc3h18Q0P678 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms