Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFFO1Q0D2I5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms