Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms