Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRATP43155 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CRATP43155 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms