Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5C1P36542 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms