Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POP4O95707 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POP4O95707 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POP4O95707 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POP4O95707 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POP4O95707 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POP4O95707 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms