Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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