Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ARID3CA6NKF2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARID3CA6NKF2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms