Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms