Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shisa5Q9D7I0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shisa5Q9D7I0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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