Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HINFPQ9BQA5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.21■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HINFPQ9BQA5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms