Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT27Q7Z3Y8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT27Q7Z3Y8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms