Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms