Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cd47Q61735 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd47Q61735 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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