Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP188Q5SRE5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms