Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms