Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSRP2Q16527 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms