Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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