Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN2Q12907 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN2Q12907 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN2Q12907 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN2Q12907 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN2Q12907 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN2Q12907 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN2Q12907 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN2Q12907 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms