Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SYCNQ0VAF6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms