Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bp1P55194 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms