Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa6P50704 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms