Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CDK2AP2O75956 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms