Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sp100O35892 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms