Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASCL3Q9NQ33 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms