Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CU638689.5-201ENST00000623892 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AP003692.1-201ENST00000521706 796 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC087894.2-201ENST00000541797 462 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC106733.1-201ENST00000624476 1038 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 LINC01934-205ENST00000435411 1771 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 DLEU1-201ENST00000378180 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SENP3Q9H4L4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SENP3Q9H4L4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms