Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfn4Q9D6I3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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