Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrs1Q9CYH6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms