Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Fcf1Q9CTH6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fcf1Q9CTH6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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