Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms