Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CalcbQ99MP3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms