Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTV1Q96GA3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTV1Q96GA3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms