Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms