Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol7cQ8C6E1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Apol7cQ8C6E1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms