Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CARMIL2Q6F5E8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CARMIL2Q6F5E8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms