Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms