Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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